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医学教育随之形成与之相适应的课程体系，包括：
①公共基础课，包括人文和社会科学课程，对学生进行文化和品德教育；
②普通基础课，包括生物学、物理学、化学、数学等自然科学课程，为学习医学打基础；
③医学基础课，关于人体正常及异常的形态结构和功能的学科，以及治疗预防的基本理论知识，为学习临床医学打基础；
④医学临床课。其教学安排是以学科为单元，遵循循序渐进的原则,先一般后医学,先基础后临床，将整个教学过程划分为三个阶段。
一为医前期，设置公共基础课和普通基础课，学生基本上不接触医学。有的国家将这一阶段教学作为医学预科放在综合性大学中进行；中国、日本、苏联、东欧国家则在进入医学院后第1～2年中学习。
二为临床前期，开设医学基础课，医学生开始学习医学的基础理论知识和技能，但不接触病人。
课程按人体正常形态结构和功能→生物致病因子→病理形态和功能的病变→药理学理论知识等顺序安排。
三为临床期，开设医学临床课并进行教学实习，课程结束后，安排一年左右的生产实习，以实习医生（护士）的身份参加临床工作。这种传统的教学模式沿袭多年，至今仍为中国以及多数国家的多数医学院校所采用。它属于学科课程教学。每一学科均根据培养目标的要求，把该门科学的浩繁的内容加以适当的选择、合理的组织和排列，使之适合于医学生的接受水平。
设置顺序
则根据各学科之间的内在联系加以安排。学生获得的知识较为系统、完整，教学形式与中学相似，学生易于适应；教师的业务专长与所担负的课程一致,教材易于编写。经验证明,这些优点有利于保证教学质量。但这种教学模式以学科为基础，致使课程门数过多，内容往往重复，学生负担过重；各学科界限分明，基础课与临床课截然分开，不利于医学生早期接触医学、早期接触病人，早日接触社会。
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